在发格系统中进行双主轴编程时，主要遵循以下步骤和指令：
启动主轴
使用指令 `M3` 或 `M4` 来启动主轴，其中 `M3` 表示正转，`M4` 表示反转。
设置主轴转速
使用指令 `Sxxx` 来设置主轴转速，其中 `xxx` 是具体的转速值（单位为RPM）。
设置主轴进给
使用指令 `Fxxx` 来设置主轴进给速度，其中 `xxx` 是具体的进给速度值（单位为mm/min）。
切换主轴焦点
使用指令 `M41` 或 `M42` 来切换主轴焦点，其中 `M41` 切换到主轴1，`M42` 切换到主轴2。
示例程序
```gcode
； 启动主轴1并设置转速为1000 RPM，进给速度为100 mm/min
M3 S1000 F100
； 切换到主轴2并设置转速为1200 RPM，进给速度为120 mm/min
M42 S1200 F120
； 主轴1执行加工操作（例如，切削）
； ...
； 主轴2执行加工操作（例如，钻孔）
； ...
； 切换回主轴1并停止
M41
M5
```
注意事项
机床和加工要求：
根据具体的机床型号和加工要求，可能需要调整编程指令和参数。
坐标系：
在编写加工程序之前，需要确定工件坐标系，并确保每个主轴的坐标系原点和相对位置关系正确。
刀具和切削参数：
根据加工对象的特点，选择合适的刀具，并设置合理的切削参数，以保证加工质量和效率。
同步与非同步运动：
根据具体加工要求，选择主轴的同步或非同步运动方式。
程序调试和修改：
在运行加工程序之前，进行程序的调试和修改，确保程序的正确性和有效性。
通过以上步骤和指令，可以在发格系统中实现双主轴的编程和控制，从而提高生产效率和加工精度。